Thực hiện thông tư liên tịch số 11/2005/TTLT-BYT-BNV ngày 12/4/2005 của liên Bộ Y tế, Bộ Nội vụ hướng dẫn chức năng, nhiệm vụ, quyền hạn và cơ cấu tổ chức cơ quan chuyên môn giúp Uỷ ban nhân dân quận quản lý nhà nước về y tế tại địa phương; ngày 26 tháng 3 năm 2007 Ủy ban nhân dân thành phố Hồ Chí Minh ra Quyết định số 49/2007/QĐ-UBND về thành lập bệnh viện quận Phú Nhuận trực thuộc Ủy ban nhân dân quận Phú Nhuận.

Với sự quan tâm của quận ủy, Hội đồng nhân dân, Uỷ ban nhân dân quận của Sở Y tế; cùng sự năng động của đội ngũ lãnh đạo, cán bộ nhân viên toàn ngành: cơ sở vật chất đã được nâng cấp ngày càng khang trang; trang thiết bị máy móc đã dần được đầu tư mạnh mẽ (chủ yếu từ nguồn xã hội hóa, hợp tác với các đối tác bên ngoài, tìm nguồn tài trợ.

Đặc biệt từ năm 2000 trở lại đây); nhân sự thường xuyên được đào tạo nâng cao trình độ chuyên môn, chất lượng phục vụ ngày càng được cải thiện rõ rệt.

Với những thành tích vượt bậc, trong 3 năm liền, ngành y tế Phú Nhuận luôn được nhận bằng khen của Bộ Y tế. Đặc biệt năm 2007, bệnh viện quận Phú Nhuận được nhận bằng khen và cờ thi đua của Bộ Y tế tặng cho đơn vị đã hòan thành xuất sắc nhiệm vụ năm 2007.

Với 100 giường nội trú, 30 bàn khám ngoại trú, đơn vị đã triển khai các kỹ thuật cơ bản của đầy đủ các chuyên khoa : Nội, ngoại, sản, nhi, mắt, tai mũi họng, răng hàm mặt, y học cổ truyền, vật lý trị liệu, phục hồi chức năng. Bên cạnh đó, triển khai một số kỹ thuật cao để chẩn đoán như chụp CT.Scanner, siêu âm màu Doppler, nội soi chẩn đoán, xét nghiệm chuyên sâu; Cùng các kỹ thuật cao trong điều trị như : chạy thận nhân tạo, phẫu thuật đục thủy tinh thể bằng phương pháp Phaco, phẫu thuật nội soi tai mũi họng, phẫu thuật thẩm mỹ, phẫu thuật chỉnh hình, điều trị vết thương mạn tính bằng chiếu tia Plasma .v.v..

Tóm lại, trải qua một quá trình dài để từng bước trưởng thành và phát triển, với sự đóng góp nhiệt tình của tập thể và cá nhân các phòng, khoa trên nhiều lĩnh vực, sự định hướng đúng đắn của ban giám đốc bệnh viện đã đưa đơn vị đi vào hoạt động có chiều sâu và tạo được niềm tin cho người bệnh khi đến Bệnh viện quận Phú Nhuận.

Đội ngũ bác sĩ