- Nghiên cứu hệ thống các phương pháp chẩn đoán, điều trị các bệnh truyền nhiễm và các bệnh nhiệt đới.
- Đào tạo và bổ túc cán bộ chuyên khoa Truyền nhiễm ở bậc đại học và sau đại học.
- Hướng dẫn, chỉ đạo chuyên môn kỹ thuật chuyên khoa Truyền nhiễm và Vi sinh lâm sàng cho Y tế cơ sở trong cả nước.
- Hợp tác KHKT trong nước và nước ngoài.
- Phổ biến các kiến thức chuyên ngành Truyền nhiễm cho mọi người, góp phần chǎm sóc sức khỏe ban đầu cho toàn dân.
- Khám và chữa người bệnh thuộc chuyên khoa truyền nhiễm và nhiệt đới tuyến cuối cùng.
Những thành tựu Bệnh viện đã đạt được
- Nghiên cứu xây dựng thành công nhiều phác đồ chuẩn về chẩn đoán và điều trị các bệnh truyền nhiễm gay dịch như: Tả, thương hàn đa kháng thuốc, sốt Dengue/SXH Dengue, HIV/AIDS,...
- Hoàn thành nhiều đề tài Nghiên cứu Khoa học cấp Nhà nước, cấp Bộ có giá trị như: Cǎn nguyên virut viêm gan, nhiễm trùng cơ hội trongHIV/AIDS, điều trị thương hàn đa kháng thuốc, bệnh học sốt mò,...
- Đang chủ trì nhiều chương trình quy mô toàn quốc: Giám sát kháng thuốc của Vi khuẩn (ASTS); Điều trị HIV/AIDS, chẩn đoán và điều trị sốt Dengue/SXH Dengue.
- Mở rộng quan hệ quốc tế với WHO, với các nước như Thụy Điển, Nhật Bản, Pháp, Thái Lan,...
- Đào tạo nhiều lớp nội trú, cao học, CKI, CKII, Tiến sỹ và là một trong những cơ sở cho sinh viên, bác sỹ nhiều nước thực tập: Pháp, Mỹ,...